Circos

[oodi]

Morjensta morjens, ensimmäistä viestiä uskalsin pistää

PItäis saada Circos ( http://mkweb.bcgsc.ca/circos/ ) futaamaan meikäläisen
MBP:llä jollain ilveellä, mutta meikäläinen on auttamattoman käsi lähes kaiken mahdollisen
koodin/koodauksen kanssa. Onnistuin "instaamaan" tuon jotenkin, mutta noitten Perl binary:n
ja output-kansioiden säätöjen kanssa oonkin sitten takonut päätä seinään päätteen kanssa eilisen.

Eli periaatteessa kysymys kuuluu: Mistä ihmeestä saan tuon Perl binaryn
(http://mkweb.bcgsc.ca/circos/?tutorials ... escription) sijainnin selville?

Kiitoksia jo ennalta

[morbusg]

Päätteeseen:
# which perl
/usr/bin/perl

[oodi]

Jesss, vallan mainiota, kiitoksia!
Mutta…tuli vielä toinenkin seinä vastaan
Pitäs saada tollane CPAN moduuli ku Config-General vielä instattua,
mutta jostain syystä pukkaa tätä vastaan:

Checking if your kit is complete...
Looks good
Writing Makefile for Config::General
-- NOT OK
Running make test
Can't test without successful make
Running make install
make had returned bad status, install seems impossible

Ehdotuksia otetaan vastaan

[gramdel]

Jesss, vallan mainiota, kiitoksia!
Mutta…tuli vielä toinenkin seinä vastaan
Pitäs saada tollane CPAN moduuli ku Config-General vielä instattua,
mutta jostain syystä pukkaa tätä vastaan:

Ehdotuksia otetaan vastaan

http://developers.slashdot.org/develope ... 5227.shtml

Varsinaisia korjausehdotuksia ei ole kyllä.

/---
ap

[morbusg]

^niin ellei sitten macportsin kautta asennetulla perlillä. Onpa muuten harmillinen moka applelta.

Eli jos haluaa niin voi perlin asentaa MacPortsin kautta (eli ensin asentaa macportsin ja sitten perlin: #sudo port install perl), jonka jälkeen perl löytyy kaiketi /opt/local/bin :stä. Mutta taitanee mennä vähän vaikeaksi.

[nobu178]

Kokeilin äsken itsekin Circosia ja mulla kyllä toi Config-General (2.42) asentui ongelmitta. Käyttis on 10.5.6 ja kaikki turvallisuuspäivitykset on asennettu.