Hopeinen Omena

Kopion yhden edf-tiedoston lääketieteellisen instrumentin muistikortilta, joka sisältää dataa itsestäni. EDF = European Data Format. Sillä siirretään ja välitetään lääketieteellistä dataa.

Olisi tarve tutkia tätä edf-tiedostoa joko Macilla tai tai Linuxilla. En löytänyt mistään valmiiksi käännettyä softaa sille, mutta lähdekoodit löysin. Macissa ei ole kääntäjää, Linuxissa on. Kun käänsin lähdekoodit Linuxissa, niin se valitti puuttuvista komponenteista joita en löytänyt mistään.

Onko jollain kokemusta kyseisestä tiedostoformaatista ja sen lukemisesta?

https://www.teuniz.net/edfbrowser/

"Asiakas" eli potilas saa vain yhteenvetotietoja, mutta se ei ihan riitä minulle. Haluan nähdä kaiken sen minkä lääkärikin näkee.

Mikä on sellainen kieli tai kehitysympäristö, johon Linuxissa on kääntäjä mutta Mac Os:ssä ei? Oletko Xcodea kokeillut?

Asenna koneelle Homebrew -pakettienhallintaohjelmisto, kopioimalla tämä komento terminaaliin:
tämän jälkeen voit samassa terminaalissa asentaa EDFbrowserin, komennolla:
äsken kokeilin asentaa M1 mäkkiin, asentui ja lähti käyntiin, toki mitään .edf tiedostoa ei ole jolla tuota kokeilisi..


Sama koodinpätkä ja lisää ohjeita löytyy projektin virallisilta sivuilta, https://brew.sh/

antoine kirjoitti: ↑23.1.2022 klo 9.04 Mikä on sellainen kieli tai kehitysympäristö, johon Linuxissa on kääntäjä mutta Mac Os:ssä ei? Oletko Xcodea kokeillut?

Ei varmaan mikään. Tässä macissani ei ole kehitystyökaluja. Edellisessä oli. Ne voisi tietysti asentaa, mutta ei ole ollut vuosiin tarvetta. Linux-koneessani on kehitysympäristö, kun olen tehnyt työkseni softaa sekä sulautettuihin että palvelimiin.

Jultsu kirjoitti: ↑23.1.2022 klo 9.19 Asenna koneelle Homebrew -pakettienhallintaohjelmisto, kopioimalla tämä komento terminaaliin:

Koodi: Valitse kaikki

/bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)"

tämän jälkeen voit samassa terminaalissa asentaa EDFbrowserin, komennolla:

Koodi: Valitse kaikki

brew install edfbrowser

äsken kokeilin asentaa M1 mäkkiin, asentui ja lähti käyntiin, toki mitään .edf tiedostoa ei ole jolla tuota kokeilisi..


Sama koodinpätkä ja lisää ohjeita löytyy projektin virallisilta sivuilta, https://brew.sh/

Brew asennus onnistui, mutta edfbrowserista tuli ilmoitus:
Warning: No available formula with the name "edfbrowser". Did you mean browser?

Jos kumminkin asentaa browserin edfbrowserin sijasta, niin tulee ilmoitus
Warning: You are using macOS 10.13.
We (and Apple) do not provide support for this old version.

Ei tässä ihan hirveästi kannata vaivaa nähdä, jos ei onnistu helposti.

EDF-tiedostoja testausta varten löytyy täältä jos sattuu kiinnostamaan vielä testaus.
https://www.teuniz.net/edf_bdf_testfiles/index.html

Koitahan vielä päivittää brewin pakettilistat, komennolla brew update.

Jos tuokaan ei auta, niin tässä latauslinkki tuohon dmg tiedostoon jonka brew konsolissa hakee: https://gitlab.com/whitone/EDFbrowser/u ... r-1.84.dmg

Tuo EDFbrowser löytyy LinuxMintin paketinhallinnasta (Synaptic tai Software Manager). Ei ihan viimeisin, on 1.72+dfsg-1, mutta toimii Mint 20.3:ssa ja luki esim. eeg_recording.zipissä olleen edf-tiedoston, en tosin ymmärtänyt siitä mitään. Mikä linux-distro sinulla on?

Jultsu kirjoitti: ↑23.1.2022 klo 15.15 Koitahan vielä päivittää brewin pakettilistat, komennolla brew update.

Jos tuokaan ei auta, niin tässä latauslinkki tuohon dmg tiedostoon jonka brew konsolissa hakee: https://gitlab.com/whitone/EDFbrowser/u ... r-1.84.dmg

Asensin tuon dmg-tiedoston. Sain ohjelman käyntiin. Muistikortilla on tavattoman paljon erilaisia EDF-tiedostoja. Osa niistä antaa virheilmoitusta, osa näyttää dataa.
Hmmm... Vaikuttaa siltä että olen kuollut kun yhdessä grafiikassa näkyy vain suoraa viivaa. Tämä vaatii vähän perehtymistä...
Kiitos avusta!

hot kirjoitti: ↑23.1.2022 klo 15.27 Tuo EDFbrowser löytyy LinuxMintin paketinhallinnasta (Synaptic tai Software Manager). Ei ihan viimeisin, on 1.72+dfsg-1, mutta toimii Mint 20.3:ssa ja luki esim. eeg_recording.zipissä olleen edf-tiedoston, en tosin ymmärtänyt siitä mitään. Mikä linux-distro sinulla on?

Foobar, Red Hat muunnelma. Sitä varten ei ollut EDFbrowseria.

Hmm, pitäisi siis olla rpm-paketti? Jos macilla on ongelmia ajaa tuota EDFbrowseria, laittaisin VirtualBoxiin Ubuntun tai Mintin (kummasta tykkää).

hot kirjoitti: ↑23.1.2022 klo 18.08 Hmm, pitäisi siis olla rpm-paketti? Jos macilla on ongelmia ajaa tuota EDFbrowseria, laittaisin VirtualBoxiin Ubuntun tai Mintin (kummasta tykkää).

En näe tarvetta siihen. Palaan noihin tiedostoihin myöhemmin paremmalla ajalla. Aiemmin mainittu dmg-paketti ei sisältänyt uusinta versiota, vaan browseri pyysi päivittämään itsensä. Päivitän joskus.

EFDbrowser kehottaa päivittämään, mutta jos sitä yrittää, niin se aukaisee pelkästään sivun: https://www.teuniz.net/edfbrowser/


Joka tapuksessa kaikki EDF-tiedostot eivät auenneet:

Työkaluilla näin kuitenkin, että tuo oli parametritiedosto.

Mutta ihan hyvääkin dataa löytyy. Tässä pari esimerkkiä: